Voor zowel het maken van, experimenten met, of de verkoop van ggo’s is een vergunning verplicht. De regelgeving voor genetische modificatie is gebaseerd op internationale regelgeving, in het bijzonder op Europese Richtlijnen en Verordeningen. Door middel van de regelgeving dient de veiligheid van mens, en milieu gewaarborgd te worden.
Naast regelgeving voor werkzaamheden met ggo’s moeten bedrijven en instellingen die met ggo’s werken ook voldoen aan allerlei regels die gelden voor andere activiteiten (bijvoorbeeld de Bestrijdingsmiddelenwet, Warenwet, Omgevingswet, Arbowet etc.).